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最后，然而，對某些疾病而言，研究人員無法依靠現有藥物來協助開發新療法。他們必須從疾病本身的已知資訊著手；但在某些情況下，這些資訊十分有限，使研究難以展開。
另外值得一提的是，目前，AI最有用的環節集中在新藥研發初期：包括識別標靶（target identification）以及尋找能與標靶結合的分子。
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